Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp5eP56382 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms