Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl9P51410 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms