Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FmodP50608 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FmodP50608 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FmodP50608 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms