Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PtpreP49446 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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