Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox8bP48772 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms