Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp4P35123 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp4P35123 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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