Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Saa4P31532 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms