Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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