Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BrafP28028 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BrafP28028 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms