Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd247P24161 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms