Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PparaP23204 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PparaP23204 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PparaP23204 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PparaP23204 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PparaP23204 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PparaP23204 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PparaP23204 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PparaP23204 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PparaP23204 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PparaP23204 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PparaP23204 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PparaP23204 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
PparaP23204 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PparaP23204 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PparaP23204 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PparaP23204 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PparaP23204 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PparaP23204 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms