Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Fcer1aP20489 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Fcer1aP20489 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Fcer1aP20489 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Fcer1aP20489 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Fcer1aP20489 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Fcer1aP20489 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Fcer1aP20489 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Fcer1aP20489 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Fcer1aP20489 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Fcer1aP20489 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Fcer1aP20489 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Fcer1aP20489 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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