Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VimP20152 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VimP20152 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VimP20152 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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