Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18527 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18527 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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