Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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