Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rag1P15919 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms