Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Egr1P08046 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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