Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprcP06800 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprcP06800 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprcP06800 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PtprcP06800 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PtprcP06800 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprcP06800 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PtprcP06800 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PtprcP06800 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprcP06800 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PtprcP06800 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PtprcP06800 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprcP06800 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PtprcP06800 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprcP06800 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprcP06800 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprcP06800 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprcP06800 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprcP06800 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprcP06800 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprcP06800 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprcP06800 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprcP06800 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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PtprcP06800 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprcP06800 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprcP06800 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprcP06800 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprcP06800 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprcP06800 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprcP06800 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprcP06800 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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