Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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