Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa7P02830 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms