Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01641 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01641 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01641 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01641 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01641 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01641 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01641 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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P01641 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01641 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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P01641 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01641 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01641 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01641 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01641 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01641 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01641 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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