Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClppO88696 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClppO88696 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ClppO88696 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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