Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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CntfrO88507 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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CntfrO88507 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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CntfrO88507 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CntfrO88507 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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