Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srpk1O70551 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms