Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NlkO54949 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NlkO54949 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NlkO54949 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NlkO54949 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms