Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajb6O54946 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajb6O54946 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajb6O54946 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajb6O54946 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajb6O54946 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajb6O54946 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajb6O54946 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajb6O54946 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Dnajb6O54946 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Dnajb6O54946 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Dnajb6O54946 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnajb6O54946 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms