Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms