Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccl25O35903 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccl25O35903 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccl25O35903 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Ccl25O35903 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Ccl25O35903 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Ccl25O35903 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms