Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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