Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms