Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq2O09161 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq2O09161 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casq2O09161 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq2O09161 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq2O09161 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq2O09161 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq2O09161 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq2O09161 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq2O09161 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq2O09161 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq2O09161 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Casq2O09161 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms