Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Mesp2O08574 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mesp2O08574 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms