Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Efna5O08543 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms