Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccer2J3QPU5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccer2J3QPU5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccer2J3QPU5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer2J3QPU5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer2J3QPU5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer2J3QPU5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer2J3QPU5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer2J3QPU5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer2J3QPU5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer2J3QPU5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer2J3QPU5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer2J3QPU5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer2J3QPU5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms