Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms