Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms