Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm20828J3KMI7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm20828J3KMI7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm20828J3KMI7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm20828J3KMI7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm20828J3KMI7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm20828J3KMI7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm20828J3KMI7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm20828J3KMI7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm20828J3KMI7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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