Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nccrp1G3X9C2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms