Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Atf6F6VAN0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms