Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm28305F6U473 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28305F6U473 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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