Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gcnt4E9Q649 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gcnt4E9Q649 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gcnt4E9Q649 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gcnt4E9Q649 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gcnt4E9Q649 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gcnt4E9Q649 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gcnt4E9Q649 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gcnt4E9Q649 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcnt4E9Q649 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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