Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5934D3Z4U6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5934D3Z4U6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5934D3Z4U6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5934D3Z4U6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5934D3Z4U6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5934D3Z4U6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms