Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms