Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c4A2ANA3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c4A2ANA3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c4A2ANA3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34c4A2ANA3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms