Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms