Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Sh3bp5Q9Z131 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Sh3bp5Q9Z131 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Sh3bp5Q9Z131 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Sh3bp5Q9Z131 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Sh3bp5Q9Z131 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp5Q9Z131 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Sh3bp5Q9Z131 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms