Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr54Q9R0D8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms