Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkd2l2Q9JLG4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms