Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr5Q9JLF7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms