Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prg3Q9JL95 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms